藻类的新陈代谢活动深刻地影响岩溶形成与发育。藻类呼吸作用产生C0 ₂ , 遇水生成碳酸, 分泌酸性物质、粘液及遗体经微生物分解, 产生C0 ₂等, 这些物质对碳酸盐岩均有溶蚀作用; 藻类的钻孔作用, 使碳酸盐岩表层形成多孔状、网络状、从而增大其化学溶蚀的有效表面积、降低其物理机械强度. 藻类通过同化作用、捕捉粘结作用等方式沉淀碳酸盐. 藻类对碳酸盐岩的作用可产生特征性产物及生物成因显微结构构造. 桂林岩溶区, 以藻类生物溶孔计算, 藻类对碳酸盐岩的最大钻孔溶蚀速率占区域混合溶蚀率的20 %.